IdentityX

複数の配列を比較するための遺伝子解析ソフト 波形の比較もできる


ソフト詳細説明

IdentityX は配列をアライメントした状態で保存し、配列の Identity を数えるために開発した Macintosh 専用のアプリケーションです。
配列内の好きな所にコメントを入れられるので、まるでノートのように使えます。
ClustalW2、シークエンスの生データのアライメントに適した「アライメント」、分子量の計算、ORFの検索、塩基配列を編集しながらアミノ酸配列を見ることのできる「Amino view」、波形ファイルを表示する「Wave view」、樹形図を表示する 「Tree view」、全体像を把握するための「Over view」、 Dot blot 、 Degenerate primer の設計、 GC 含量や疎水性の程度を表す「プロット」など、生物学で使う機能も多彩です。
さらに通常の「or 検索」だけでなく、一致率を指定したあいまいな検索や、二つの条件を満たしたもののみ検索する「and 検索」、検索語の末端だけを検索対象とする「末端検索」、複数の検索語をまとめて or 検索する「ぐるっぱ検索」など他のソフトでは見られない高度な検索が可能です。
詳細は http://home.hiroshima-u.ac.jp/kei/IdentityX/index.html をご覧下さい。

Mac OS 10.4 以降に対応

利用条件・試用期間中の制限など

編集、保存、印刷などを含むほとんどの機能が無料で使えますが、波形ファイルを表示する「Wave view」、樹形図を表示する 「Tree view」、全体像を把握するための「Over view」、 GC 含量や疎水性の程度を表す「プロット」における色の指定など一部の機能を利用するためにはライセンスの取得が必要です。ライセンスの取得方法は http://www.megaegg.ne.jp/~keisuke/index.html をご覧下さい。ライセンス料金は 50000 円です。

動作環境

IdentityXの対応動作環境
ソフト名:IdentityX
動作OS:OS X
機種:Mac PPC Intel Mac
種類:シェアウェア:50,000円
作者: 中島 圭介 

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